Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDF5P43026 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDF5P43026 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms