Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrgnP13609 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrgnP13609 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrgnP13609 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrgnP13609 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrgnP13609 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrgnP13609 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms