Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl20O89093 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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