Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JRKO75564 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JRKO75564 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JRKO75564 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms