Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVV-2B6SEH9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms