Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms