Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms