Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FGD4Q96M96 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms