Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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