Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms