Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms