Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms