Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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