Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms