Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTFP26441 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTFP26441 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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