Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms