Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms