Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms