Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms