Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms