Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LSP1P33241 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LSP1P33241 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSP1P33241 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms