Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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