Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3AO14802 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms