Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms