Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a4Q9Z306 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc22a4Q9Z306 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc22a4Q9Z306 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a4Q9Z306 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms