Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17h6s53eQ9Z1R4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
D17h6s53eQ9Z1R4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17h6s53eQ9Z1R4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms