Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf394Q9Z1D9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf394Q9Z1D9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf394Q9Z1D9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms