Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn5Q9WVD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms