Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx1Q9WV80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms