Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nrf1Q9WU00 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrf1Q9WU00 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms