Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fhl3Q9R059 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms