Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms