Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1aQ9QYR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms