Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc4Q9QUQ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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