Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms