Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad9Q9JIW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms