Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf23Q9ER63 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms