Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif3fQ9DCH4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif3fQ9DCH4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms