Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg8Q9DBM0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg8Q9DBM0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms