Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9U9

Cfap45, Ccdc19 protein, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap45Q9D9U9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap45Q9D9U9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap45Q9D9U9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap45Q9D9U9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms