Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx5Q9D8U8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx5Q9D8U8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms