Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms