Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins3Q9CY94 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins3Q9CY94 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms