Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl39lQ9CQD0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Rpl39lQ9CQD0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpl39lQ9CQD0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpl39lQ9CQD0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpl39lQ9CQD0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpl39lQ9CQD0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl39lQ9CQD0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl39lQ9CQD0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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