Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim26Q99PN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim26Q99PN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim26Q99PN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms