Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PccbQ99MN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PccbQ99MN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PccbQ99MN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms