Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc33a1Q99J27 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc33a1Q99J27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc33a1Q99J27 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms