Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caskin2Q8VHK1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caskin2Q8VHK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Caskin2Q8VHK1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caskin2Q8VHK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms