Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc9Q8VC31 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc9Q8VC31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms