Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxn4Q8K3Q3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxn4Q8K3Q3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxn4Q8K3Q3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms